Результаты исследования останков неоднозначны. Американские учёные, не обнаружив на них очевидных повреждений, склоняются к версии, что дети умирали по естественным причинам. Но с другой стороны, никакая экспертиза спустя столько веков не сможет определить такие причины смерти как удушение или утопление.

По одной из версий сюда приносили умерших детей и молили божеств о здоровом потомстве, но само слово «тофет» встречается в Ветхом Завете и означает священное место, где богам приносились человеческие жертвы. Поэтому по другой версии здесь располагалось оккультное святилище, использовавшееся для жертвоприношений. Новорождённых убивали, чтобы получить милость от божеств-покровителей. Прах ещё недоразвитых младенцев объясняется вырезанием детей из утроб матерей, которые не хотели в будущем отдавать их жизни богам.

Существует легенда о приношении детей в жертву Ваалу карфагенянами. Для того, чтобы божество было благосклонно к жителям, семья должна была пожертвовать ему первенца. Но большинство историков считает, что в тофете хоронили детей, которых приносили в жертву Молоху. Это мнение основано на сообщениях античных авторов.

Например, Диодор Сицилийский писал, что сиракузский тиран Агафокл в 310 г. до н. э. разбил карфагенскую армию и окружил город. Тогда Совет Ста четырёх (верховный орган управления Карфагена) выбрал 200 знатных семейств, которые должны были принести в жертву своих младенцев богу Молоху, а ещё 300 граждан отдали детей на заклание добровольно. Спасение города явилось для его жителей высшим оправданием понесённых жертв.

А пока споры о происхождении тофета продолжаются, многие из откопанных урн выставляются в музеях Туниса и Карфагена, а сами раскопки часто посещаются путешественниками.